1024x768 1280x800   Decrease font size for  - 拓展台灣數位典藏 - 數位典藏與數位學習國家型科技計畫 拓展台灣數位典藏計畫網站 Reset to normal font size for  - 數位典藏與數位學習國家型科技計畫 拓展台灣數位典藏計畫網站 - 拓展台灣數位典藏 Increase font size for  - 拓展台灣數位典藏
 


農業試驗所典藏研究膜翅目昆蟲標本數位化計畫數位化工作流程

Tags: , , , , , , 發表: 2009-11-09, 點閱: 4,443 , 加入收藏櫃 , 列印 列印 , 轉寄 轉寄

想加入的書籤: HemiDemi MyShare Baidu Google Bookmarks Yahoo! My Web Del.icio.us Digg technorati furl 加入此網頁到:YouPush . . 推到twitter 推到plurk 推到FACEBOOK

計畫單位 行政院農業委員會農業試驗所 應用動物系

 

 

計畫主持人陳淑佩助理研究員

 

 

計畫名稱:農業試驗所典藏研究膜翅目昆蟲標本數位化計畫

(Taiwan Agricultural Research Institute Hymenoptera Research specimens Digital Archives Project)

 

 

計畫簡介

昆蟲標本蒐藏之主要目的在於藉由昆蟲標本和相關資料的取得、保存與維護,做為自然歷史的佐證,經由標本的研究以瞭解自然史,並將蒐藏之標本及研究所得之成果提供人類學習與瞭解的途逕;因此標本的主要功能在於提供展示、科學教育及科學研究。而近年在全球提倡生物多樣性公約以來,昆蟲這一類物種多樣性最高的類群更是受到高度的重視;為了永續利用昆蟲資源,必須以最有效率的方式來加以管理。標本為無價之寶,應當受到相當高度的重視及妥善的管理與維護。本計畫主要針對農業試驗所昆蟲學系昆蟲標本館之館藏膜翅目標本為對象,將規劃進行硬體更新與標本管理系統建立、昆蟲標本資料庫建立與重要典藏標本數位化等工作項目。

 

  目      錄 

計畫簡介


工作流程圖

 

一、清查標本及數量

 

二、建立數位化之物種清單及流水號

 

三、標本拍攝

 

數位典藏工作流程調查表

 

 

計畫目標:

 

1. 定名證據標本之數位化

2. 蒐集各物種之相關文獻

3. 尋求國際學者之合作協助,將有關標本重新檢閱,以確定其真正分類地位

4. 舊地名的更新

 

 

計畫網站:http://digiins.tari.gov.tw/

 

農業試驗所昆蟲標本數位典藏化流程

 1、膜翅目昆蟲標本數位化工作流程圖

 

 

 


 

<目 錄>

 

 

一、 清查標本及數量

 

由具電腦文書處理及文獻管理能力,動物人員命名法規及系統分類學訓練之人員來進行標本清查以及數量清點的工作,包含分析並清查物種標本等相關分類書籍文獻資料,及確認學名、位置、數量、類型等相關標本之文字資料。

 

1. 文獻資料數位化:由於標本之定名籤有可能因為人為疏失誤植或誤置,因此除藉線上瀏覽方式由使用者回饋修正外,文獻資料將是現階段最佳的校對方式。

 

(1) 文獻清查:利用線上期刊、全國碩博士論文檢索、館際合作等查詢相關資訊。

 

(2) 文獻資料分析:解讀文獻、釐清物種間的分類群關係。

 

(3) 文獻資料metadata建檔:標本拍攝完後將作者、年代、書目、篇目、出版者、頁碼等metadata建檔。

 

(4) 匯入資料庫:最後上傳至資料庫。

 

2、相關文獻資料

 

2. 文字資料數位化:利用文獻清查資料將所得文字進行蒐集、彙整、校對工作,內容包含確認學名、位置、數量、類型。其中由於農試所標本多來自於日據時期,須進行舊地名更新工作,詳實記錄該標本所在位置,並依循「台灣昆蟲採集新舊地名對照表(台灣省立博物館科學年刊)」為標本位置之參考依據。

 

 

 

 

 


<目 錄>

 

 

 

 

二、 建立數位化之物種清單及流水號

 

(一) 數位化物種清單:以excel表格建立欲數位化之標本清單。

 

1. 依館已定名之標本與數量多寡、呈現多樣化之收藏來決定數位化順序。

 

2. 各科物種欄位包含「流水號」、「科名」、「亞洲族名」、「學名」、「標本位置」、「數量」、「文獻」、「pdf」、「標本類型」、「標本照」、「資料庫填寫」、「上傳資料」等共12個欄位。

 

3. 由於有些標籤學名字跡不清楚,因此會進行清查後才填寫於表單上。

 

5、膜翅目標本數位化清單

 

(二) 建立標本流水號

 

物種的流水號依照不同的英文科名縮寫來依序命名,號碼將包含年度、物種、採集地區、影像部位等編號。例如:dryi0700100101依序代表 科名(螯蜂科Dryi)、年度(07)、物種(001)、採集地區(001)、影像部位(01)。以下為流水號建立規則:

 

表格 1、標本流水號建立規則

 

科名

前4碼

年度

(西元末2碼)

標本物種

編號3碼

採集地區

編號3碼 (手寫加入)

標本影像部位

編號2碼

xxxx

Dryi(螯蜂科)

xx

07

08

xxx

001

xxx

001

xx

01側面

02側胸

03背板

04 (蟲體其他部位)

05 (蟲體其他部位)

08蟲籤 一

09 蟲籤 二

10 頭部一

11頭部 二

 

 

 

 


<目 錄>

 

 

 

三、 標本拍攝

 

(二) 前置作業

 

1. 數位化清單

 

自物種清單excel檔案中列印所需表單,並以此為標本拍攝工作紀錄註記處。

 

6、膜翅目標本數位化清單

 

2. 數位化設備

 

拍攝物件包含昆蟲標本及其標籤(採集籤、定名籤),前者以CANON S80與實體顯微鏡拍攝昆蟲標本,後者以CANON S80與翻拍架拍攝之。

 

l 昆蟲標本拍攝設備:CANON S80、實體顯微鏡、照明設備、標本燈箱

 

 

l 標籤拍攝設備:CANON S80、翻拍架、照明設備、玻璃墊(非反光)

 

 

3. 相關輔助工具

數位化工作須備妥手套、口罩、大小方正海綿、鎳子、刷子等工具。其中海綿是有利於拍攝昆蟲側面、側胸、背板、背部、頭部等部位之工具。

 

10、相關數位化輔助工具

 

 

(三) 標本拍攝工作

1. 移除物種標本標籤

 戴手套將物種標本自盒中取出,置於海綿上,以攝子取下蟲籤。

 

 

 11、物種標本標籤

 

2. 拍攝數位典藏流水號標籤

 

以拍攝物種標本的設備先記錄該標本之數位典藏流水號標籤(下圖左側標籤),其內容為科名(ichn)、年度(08)、物種(081)、採集地區(003)。由於實體顯微鏡並非持續光源,因此除調整相機外,需一併調整光源。

 12、數位典藏流水號標籤拍攝

 

3. 拍攝前標本整理工作

由於欲拍攝物種標本之側面、背板、背部、頭部等部位,需先以毛筆進行標本清整工作,避免同時將雜質拍入。若遇標本狀況不佳時,會以無酸卡紙以及黏蟲膠進行修復工作。

 

 13、數位典藏流水號標籤拍攝

 

4. 進行物種標本拍攝

依研究標本狀況拍攝其側面、側胸、背板、背部、頭部與其他部位,為求能清晰拍攝標本各部位特徵,因此每一特徵需費時拍攝較多張影像,以作為影像後置處理的篩選,目前規劃每一隻物種標本拍攝最少4張部位,每一部位至少拍攝5~10張照片供挑選。目前本館每一物種至少典藏1~5隻標本,其影像規格訂為:3648×2432dpi。另外由於實體顯微鏡並非持續光源,因此除調整相機外,需一併調整光源,以利各部位的特徵拍攝工作。拍攝規劃如下:

 

(1) 相同物種標本來自不同採集地點時(>1000),將選擇不同採集地點具代表性的標本標本拍攝之。

 

(2) 相同物種來自不同採集地點時(<5),則會全數進行標本拍攝工作。

 

(3) 保留插針,直接進行標本不同部位的拍攝工作。

 

(4) 拍攝以約佔螢幕九成滿,與下一步驟的標籤拍攝工作不同。

 

 

 

 

(四) 流水號標籤拍攝工作

 

1. 拍攝數位典藏流水號標籤

以翻拍架拍攝流水號標籤,由於此翻拍架之照明設備為持續光源,因此僅需調整相機焦距確定影像清晰度即可。另外,壓住標籤的為不反光玻璃。

 

15、流水號標籤拍攝工作

 

2. 拍攝物種標本之蟲籤

以翻拍架拍攝流水號標籤以及定名籤、採集籤等,由於此翻拍架之照明設備為持續光源,因此僅需調整相機焦距確定影像清晰度即可。

 

3. 於物種清單紀錄之

 

 16、蟲籤拍攝工作

 

(五) 編修物種標本影像檔

 

1. 挑選各部位所拍攝之5-10張中最適合的1張影像檔進行編修。

 

2. 由具備數位影像處理以及色彩調校人員利用ACDSee、PhotoImpact,針對影像檔置之「白平衡」、「色階」、「清晰度」、「亮度與對比」等項目加以編修並另存新檔為典藏級影像檔。

 

3. 將編修好的影像檔轉存為符合網頁像素規格為500×375dpi,解析度72dpi之規格,在維持寬高比之下,調整大小、寬度、像素,將其另存為網站上傳之瀏覽級影像檔。

 

 

(六) 再次清查相關標本文獻資料

待檔案編修完後,需再進行物種標本的再鑑定,雖然鑑定工作已在文獻與清單步驟執行過,但為求慎重會待影像編修完後再次進行確認,除比對蟲籤與流水號籤外,再次參考相關昆蟲標本分類書籍,包含來自國內外相關的文獻資料,加以比對以利資料的正確性。

 

 

(七) 批次上浮水印

 

(八) 建立基本資料及文獻檔案

除鍵入物種基本資料外,將所蒐集之物種相關文獻一併新增。其欄位包含文獻、物種以及標本的後設資料共通欄位是由主題小組共同制定。

 

(九) 建立物種標本資訊與圖檔資料

輸入影像檔相關欄位資訊,包含基本分類、型態、生態等物種資訊以及圖檔相關資料。

 

(十) 產出數位化圖檔與文字完成清單

待影像檔與後設資料完成後,匯出一份數位化物種項目清單,其中包含完成日期、科名、物種、標本隻數、影像檔數量、metadata以及上傳網站等資料。

圖 19、完成清單

 

(十一) 匯入資料庫

定期由具電腦文書處理與文獻管理能力,動物命名法規、系統分類學訓練之人員進行資料匯入的動作。將分為「標本資訊檔案上傳」、「參考文獻檔案上傳」、「圖檔基本資訊上傳」、「圖檔新增」等四個部分,其中區分上傳以及更新兩功能。

1. 標本資訊檔案上傳

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

2. 參考文獻檔案上傳

 

  

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

3. 圖檔基本資訊上傳

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

4. 圖檔新增

 

 

 

 

 

 

(十二) 檢查網頁資料正確性

資料校對工作上,除利用文獻資料和相關分類書籍核對外,待資料上傳後同步藉由網站使用以及瀏覽的方式再次確認資料的正確性,包含影像檔與metadata是否符合、影像檔是否可以正常顯示等項目。

 

 

(十三) 定期備份

採用外接式硬碟將數位化檔案異地備份。

 

 

 

 


<目 錄>

 

 

數位典藏國家型科技計畫內容發展分項計畫數位典藏工作流程調查表

 

單位:行政院農業委員會農業試驗所
數位化物件名稱:昆蟲標本
子計畫名稱:農業試驗所典藏研究膜翅目昆蟲標本數位化計畫
分項計畫名稱內容發展
主持人(負責人)(E-mail、Tel):

陳淑佩

spchen@wufeng.tari.gov.tw

04-23302301#626

聯絡人(E-mail、Tel):

林秀枝

linshowje@Yahoo.com.tw

04-23302301#626

 

程序

工作內容

操作人員(數量、專業能力之要求)

硬體(名稱、版本、價格)

軟體(名稱、版本、價格等)

依循標準(技術規範、成品規格、品質要求…等)

耗時

總結(困難、缺失、特色…等)

成本估算

備註

1

標本分類地位及基本資料清查驗證登錄

1員,具電腦文書處理及文獻管理能力,動物命名法規、系統分類學訓練

ASUS Intel?Core(TM)2 (約50,000 元)
蒐集與本計畫相關之文獻

文件製作、試算表 Excel (約 8,000、Word(約 8,000)、文獻管理軟體 Endnote (約 12,000)

圖書分獻資料交換標準(MARC)

4小時/天 x 5天/週 x 4 週 x 12月

(月薪21,523)

 

157,138

 

2

標本影像拍攝數位化

2員,數位影像拍攝、昆蟲標本處理

Canon S80 x 2 (約80,000)、
實體顯微鏡及其照明設備等 x 2, (約800,000)、

翻拍架及其照明設備、標本燈箱一組 (約50,000)

 

依研究標本狀況拍攝其側面、側胸、背板、背部、採集籤、定名籤、頭部及其它部位,每一隻物種標本拍攝最少4 張部位;且同物種不同採集地則選擇最佳標本拍攝之,每一物種至少1~5隻標本。

影像像素規格為3648 x 2432

8小時/天 x 5天/週 x 4週 x 10月

(月薪33,583)

8小時/天 x 5天/週 x 4週 x 10月

(月薪21,523)

困難:每一隻物種標本拍攝最少4 張部位,且拍攝的微型膜翅目標本特徵求清晰,所以每一特徵需費時拍攝較多張影像,以做為影像後製處理的篩選。

特色:每一隻物種標本拍攝最少4 張部位;每一物種至少1~5隻標本。

1,481,060

 

3

標本數位化影像檢視及後製處理

1員,具數位影像處理、色彩調校等能力

ASUS Intel?Core(TM)2 (約50,000 元)

AcdSee (約 1780)
PhotoImpact 12 (約4,500)

網頁像素規格為500 x 375 dpi,解析度72 dpi

4小時/天 x 5天/週 x 4週 x 10月

(月薪33,583)

 

390,330

 

4

後設資料規格建立及資料庫系統設計、架構

1員,資料庫設計,SQL語言撰寫,系統分類學訓練

IBM HS21 (一刀)

(96000元)

MySQL 5.0.45 (Free)

PHPMyAdmin 2.10.3 (Free)
Navicat 8.0 (約6,500)

DarwinCore

8小時/天 x 90天(月薪33,583)

 

203,249

 

5

網站系統軟體及環境架構及網頁設計、備份至檔案伺服器

1員, HTML及CSS網頁設計及網站管理,系統分類學訓練

IBM HS21 (一刀)

(96000元)

PHP 5.2 (Free)

Dreamweaver (約16,900)
PhotoImpact 12 (約 4,500)

 

8小時/天 x 90天
(月薪33,583)

 

218,149

 

6

建立Metadata欄位資料、上傳資料庫;檢視校訂Metadata及網頁資料

1員,具電腦文書處理及文獻管理能力,動物命名法規、系統分類學訓練

ASUS Intel?Core(TM)2

(約50,000 元)

試算表 Excel( 約8,000 )

 

4小時/天 x 5天/週 x 4週 x 9月

(月薪21,583)

 

252,247

 

註:若程序多於七個,請複製本表使用

 

調查人:陳淑佩 調查地點:行政院農業委員會農業試驗所 調查日期:2008/1/30

 


<目 錄>









Download: 全文下載  全文下載 (2.7 MB, 1,124 hits)



評分:

1 Star2 Stars3 Stars4 Stars5 Stars (No Ratings Yet)
Loading ... Loading ...

回應:


請輸入圖片中的文字
請按圖片取得圖片中文字的錄音檔
Click to hear an audio file of the anti-spam word