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國立台灣大學 昆蟲標本館數位典藏計畫 數位化工作流程簡介

Tags: , , , , , , , 發表: 2008-08-08, 點閱: 6,107 , 加入收藏櫃 , 列印 列印 , 轉寄 轉寄

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計畫簡介

 

台灣大學從民國八十六年即進行「國立台灣大學數位圖書館暨博物館計畫」,結合人類系、圖資系、歷史系、資工系、圖書館等單位的人力,開始將典藏的珍貴文獻、器物數位化,並自八十七年起同參與國科會數位博物館計畫。台灣大學的珍貴典藏涵蓋歷史文獻、考古、地質、動物、植物、昆蟲等,其中多與台灣本土有關。

 

台灣大學昆蟲標本館成立於日據時代,收藏無數珍貴標本;在台灣地區與農業試驗所並稱藏量最豐之兩大昆蟲標本館。蒐藏昆蟲標本的主要目的在於藉由昆蟲標本和相關資料的取得、保存與維護,作為自然歷史的佐證,經由標本的研究以了解自然史,並將蒐藏之標本及研究所得之成果提供人類學習與了解的途徑;因此標本的主要功能在於提供展示、科學教育及科學研究。而近年在全球提倡生物多樣性公約以來,昆蟲這一類物種多樣性最高的類群更是受到高度的重視;為了永續利用昆蟲資源,必須以最有效率的方式加以管理。標本為無價之寶,應當受到相當高度的重視及妥善的管理與維護。

 

 

本年度工作項目為:

 

1. 清查昆蟲標本館收藏之標本,作分類與整理。

 

2. 模式標本影像數位化。

 

3. 蟲籤等舊有資料建檔及數位化。

 

4. 常見昆蟲(研究及教學標本)影像數位化。

 

5. 標本metadata文字資料庫建檔與校對。

 

6. 昆蟲管理系統網頁架設。

 

7. 對外查詢檢索網頁測試。

 

數位化工作流程:

 

台灣大學昆蟲標本館典藏數位化計畫之數位化工作流程圖文說明,共分成三部分同時進行數位化工作,即常見昆蟲解說文字資料庫常見昆蟲標本照模式標本照,其各部分之細部數位化步驟,如下:

 

 

圖一、完整數位化工作流程圖

 

 

l 常見昆蟲解說文字資料庫

圖二、常見昆蟲解說文字資料庫流程圖

 


 

<目 錄>

 

 

一、 標本整理

 

由熟悉昆蟲分類與整理方法的工讀生2名,利用標本箱、標本盒、鑷子…等其他工具,大約每盒花費1個半小時,常見昆蟲標本選取自己完成鑑定至科之研究與教學標本,數量極大,且歷史悠久,正逐步清查整理中。

 

圖三、標本整理

圖四、選取完整且具代表性之昆蟲標本

 


 

<目 錄>

 

 

二、 核對標本、查閱書籍

 

由具有昆蟲分類專長的2名工讀生,利用標本箱、標本盒、鑷子…等其他工具,大約花費每隻30分的時間,參考普通昆蟲學…等書籍,核對標本、查閱書籍該標本之相關資訊。

 

圖五、查閱相關書籍

 


 

<目 錄>

 

 

三、 分析整理文字資料

 

由修習過昆蟲分類學與實習的2名工讀生,利用PC之MS2000之Word & Access套裝軟體,進行分析整理文字資料,每筆資料大約需耗時50分鍾,並且在此進行同時,再必要時亦有碩士級助理從旁協助該名工讀生於分析整理文字資料。

 

圖六、分析整理文字資料

 


 

<目 錄>

 

 

四、 輸入metadata

 

由2名工讀生進行將所整理分析之文字資料,依照中央研究院動物主題小組統一之共通欄位,將資訊輸入欄位並儲存,以完成每筆metadata,每筆約需30分鐘來完成。

 

圖七、key in metadata(暫用Access)

 

圖八、常見昆蟲文字資料庫

 


 

<目 錄>

 

 

五、 特徵辨識

 

由2名工讀生進行查閱專業書籍並核對標本,利用PC與LEICA顯微鏡…等工具施行,每隻標本約需耗時30分鐘。

 

圖九、特徵辨識-1

圖十、特徵辨識-2

 


 

<目 錄>

 

 

六、 特徵影像圖說

 

由2名工讀生整理標本相關資料,利用PC並參考昆蟲分類學以進行特徵影像圖說,每隻標本大約需耗時20分鐘。

 

圖十一、輸入特徵影像圖說

 


 

<目 錄>

 

 

七、 校對

 

由1名需具有昆蟲分類背景之工讀生,利用PC並參考昆蟲分類學以進行校對的工作,每筆資料大約需耗時20分鐘。

 

圖十二、校對

l 常見昆蟲標本照

圖十三、常見昆蟲標本照流程圖

(內容)

 

一、 標本分類與整理

 

常見昆蟲標本選自已完成鑑定至科之研究與教學標本,數量極大,且歷史悠久,正逐步清查整理中。由2名熟悉標本處理的工作人員,利用標本箱、標本盒、蟲籤、鑷子…等相關工具,將常見昆蟲標本分類並整理,每盒平均處理約為一個半小時。

 

圖十四、標本分類與整理

 

二、 挑選合適標本

 

由兩名具有昆蟲分類背景的工作人員,使用鑷子、放大鏡或LEICA顯微鏡以及電腦,來挑選合適的昆蟲標本,平均每隻昆蟲處理時間約為15分鐘。

 

圖十五、挑選合適標本

 

 

三、 拍照標本照

 

由2名具有昆蟲分類背景並熟悉使用攝影工具的工作人員,利用LEICA顯微鏡、Chroma數位攝影機、NIKON D1數位相機、VISIO翻拍燈與翻拍架,將選出的昆蟲標本進行數位攝影步驟,每隻昆蟲翻拍約需耗時約40分鐘。

 

圖十六、大型標本使用Nikon D1數位相機及翻拍架、翻拍燈

圖十七、拍攝1

圖十八、拍攝2

圖十九、拍攝3

圖二十、蝴蝶標本

 

 

四、 標本照去背及後續影像處理

 

由2名熟悉影像處理軟體的工作人員,將之前已數位攝影完成之數位影像檔進行後續處理工作,如去背、修色…等工作,每筆影像檔約需耗時1小時。未來則考慮委外製作。

 

圖二十一、去背處理

 

 

五、 標本照加浮水印處理

 

此步驟由中央研究院資訊所支援,並尚未進行浮水印處理。

 

六、 標本照命名與建檔

 

由2名熟悉文書處理的工作人員,將修訂好的常見昆蟲標本照(數位影像檔),存成三種不同大小與解析度的圖檔,每筆轉存不成格式影像檔,約需耗時15分鐘,該三種影像檔包括典藏檔、電子商務檔、公共資訊檔,均依據技術彙編的影像檔規格。

 

七、 查詢分類資料

 

由2名具昆蟲分類背景的工作人員,開始查詢各昆蟲標本照之分類資料,並參考普通昆蟲學…等參考書目,每筆資料約耗時30分鐘處理完成。

 

圖二十二、查閱相關書籍

 

 

八、 拍攝科級特徵影像

 

由2名會操作攝影工具之工作人員,利用電腦、LEICA顯微鏡、Chroma數位攝影機…等工具,近處拍攝昆蟲細部特徵,每隻昆蟲約耗時1小時拍攝科級特徵。

 

圖二十三、選取玻片標本

圖二十四、選取玻片標本

圖二十五、玻片標本

圖二十六、使用光學顯微鏡擷取影像

 

圖二十七、科級特徵辨識

 

圖二十八、使用數位攝影機拍攝

 

 

九、 後續影像處理

 

由2名熟悉影像處理軟體的工作人員,利用影像處理軟體,將上步驟所拍攝之特級特徵,進行影像處理與修正,每筆資料約需耗時1小時。

 

圖二十九、影像處理

 

圖三十、套上底色並加註物種名稱

 

 

十、 特徵影像加浮水印處理

 

此步驟由中央研究院資訊所支援製作,並尚未進行特徵影像加浮水印處理。

 

十一、特徵影像命名與建檔

 

由2名熟悉文書處理的工作人員,將經過影像處理完成之常見昆蟲標本照圖檔以及特級特徵圖檔,進行命名,並在資料庫輸入介面建立圖檔,每筆資料約耗時15分鐘。

 

圖三十一、特徵影像建檔與命名

 

十二、再次校對後上傳至網頁

 

由2名具有昆蟲分類背景之工作人員,再次將資料庫中之資料進行二次校對,待正確無誤之後始傳至網頁上,供使用者利用。每筆皆約需10分鐘處理。

 

十三、資料備分

 

由1名工作人員,將正確無誤之所有資料,利用燒錄軟體NERO 5.5,燒錄成DVD光碟。每筆燒錄約需耗時20分鐘。

 

圖三十二、資料備份

 

圖三十三、燒錄光碟片

 

 

 

 

 

 

 

l 模式標本照

圖三十四、模式標本照流程圖

 

一、 標本維護修復

 

由1名熟悉昆蟲標本整理工作的工作人員,利用顯微鏡、鑷子…等製作標本工具,並參考普通昆蟲學,執行標本維護修復,本之標本製作時間不定,全視標本狀況而定。

 

本館所典藏之模式標本多為日據時代迄今,因年代久遠且保存設備老舊,致標本多有虧損,故整理上有一定之困難度。

 

圖三十五、標本維護修復

 

二、 分類整理

 

由1名具有昆蟲學分類學背景的工作人員,利用昆蟲標本箱製作標本相關用品,並參考普通昆蟲學參考書目,來整理並分類這些模式標本,其每隻模式標本處理時間,並無一定,全依照該標本狀況而定。

 

圖三十六、分類整理

 

三、 拍攝模式標本照

 

由2名熟悉使用攝影器材的工作人員,利用顯微鏡、數位攝影機、環行燈、電動手臂、數位相機…等工具,執行模式標本的拍照,模式標本的執行速度,全視標本狀況而定。

 

圖三十七、對焦與位置調整

 

圖三十八、拍照—顯微攝影

 

圖三十九、Leica顯微鏡及數位攝影機

 

圖四十、電動手臂

 

四、 多張模式標本照影像合成

 

由1名熟悉影像合成軟體的工作人員,使用auto-montage、MS-2000…等軟體工具,進形模式標本的影像合成作業,平均每張影像約處理10分鐘。

 

圖四十一、影像合成步驟-a.選取連續影像檔

 

圖四十二、影像合成步驟-b.檔案開啟中

 

圖四十三、影像合成步驟-c.開啟完成

 

圖四十四、影像合成步驟-d.將各影像檔校正

 

圖四十五、影像合成步驟-e.校正完成

 

圖四十六、影像合成步驟-f.選擇合成方式

圖四十七、影像合成步驟-g.影像合成中

圖四十八、影像合成步驟-h.影像合成完成

 

五、 模式標本照去背及後續處理

 

由2名熟悉影像處理軟體的工作人員,利用MS-2000、Photoshop 6.01、KNOCK-OUT…等軟體工具,進行去背與後續處理,平均每一張約進行1小時。

 

圖四十九、影像檔案去背處理-a.開啟合成影像檔

 

圖50:影像檔案去背處理-b.去除蟲針及背景雜色

圖五十一、影像檔案去背處理-c.去背完成

圖五十二、影像檔案去背處理-d.加上比例尺及物種學名

圖五十三、影像檔案去背處理-影像檔案後續處理(例二)

圖五十四、影像檔案去背處理(例二)-a.去除背景雜色

圖五十五、影像檔案去背處理(例二)-b.旋轉影像30°(順時針)

圖五十六、影像檔案去背處理(例二)-c.加上合適底色及細部修復

 

六、 模式標本照建檔與命名

 

由2名熟悉影像處理軟體,利用MS-Access、Photoshop 6.01…等軟體工具,將檔案與命名方式依照規格,轉存三種影像檔格式,平均處理15分鐘。

 

圖五十七、建檔與命名

 

圖五十八、蟲籤

圖五十九、蟲籤拍攝

 

圖六十、輸入後設資料-模式標本資料庫-紀錄蟲籤資料

 

七、 模式標本照加上浮水印處理

 

本步驟預計由中央研究院資訊所支援,並尚未進行模式標本照加浮水印處理。

 

八、 資料備份

 

由1名會操作燒錄軟體的工作人員,運用燒錄機Nero 5.5…等軟體工具,燒錄成DVD,平均每片DVD約耗時15分鐘。

 

圖六十一、資料備份

 

圖六十二、燒錄DVD

 

九、 上傳網頁

 

由1名熟悉電腦操作的工作人員,將資料上傳至網頁,此部分是由中央研究院資訊所支援,平均所費時間皆視檔案大小時定。

 

※以上數位化工作流程簡介之文字,主要是參考「台大昆蟲標本館常見昆蟲解說文字資料庫數位化工作流程調查表」、「台大昆蟲標本館常見昆蟲標本照數位化工作流程調查表」、「台大昆蟲標本館模式標本照數位化工作流程調查表」、【國家數位典藏國家型計畫中程綱要計畫書】。

 

※製作單位:數位典藏國家型科技計畫-內容發展分項計畫

 

台灣大學昆蟲標本館典藏數位化計畫

 

※文字撰寫:台灣大學昆蟲標本館典藏數位化計畫計畫助理 童鈺珽小姐

 

※圖文編輯:數位典藏國家型科技計畫-內容發展分項計畫

 

動物主題小組助理 汪怡慧、曾欣怡

 

※圖片拍攝:台灣大學昆蟲標本館典藏數位化計畫計畫助理童鈺珽小姐

 

動物主題小組助理 陳冠伊

 

※感謝:台灣大學「台灣大學昆蟲標本館典藏數位化計畫」之計畫主持人蕭教授旭峰撥冗指導及提供實地拍攝與簡介編寫。並感謝童鈺珽小姐等相關計畫人員的協助

 


 

<目 錄>

 

 

 









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