台灣大學植物標本館典藏數位化計畫 數位化工作流程
Tags: 工作流程, 徵稿, 數位典藏, 數位化, 數位學習, 會議, 植物, 檔案, 資料庫 發表: 2008-08-08, 點閱: 20,977 , 加入收藏櫃 , 列印 , 轉寄
單位:台灣大學植物學系標本館
計畫主持人:台灣大學植物系 謝長富先生
國立台灣大學植物標本館成立於1928年,從日據時期便開始大量蒐藏台灣本地植物,迄今已有二十五萬份以上。這些標本代表台灣維管束植物種類百分之九十五以上,其中三分之二的標本為台灣地區固有的種類。由於從日據時期便開始蒐藏,除了藏有植物學上最珍貴的模式標本一千餘外,並藏有五十年前所採集的本省固有植物且深具研究價值的老標本六萬餘份。
為更有效利用及管理這些標本,本子計畫擬於五年內完成館藏資料庫之數位化並納入網站,以利永久典藏、學術研究、專業教學及通俗教育之用。
計畫目標:91年~95年預計數位化目標為
1. 模式標本影像資料庫
2. 老標本及代表性標本影像資料庫
3. 典藏標本之後設資料庫
4. 古今採集地名資料庫
5. 台灣植物誌第二版(Flora of Taiwan)數位化
工作流程說明:
本館所典藏之模式標本約1000餘份,包含台灣、太平洋諸島等地的物種,非常珍貴。將此等標本製成高解析度影像檔,並收集各模式標本原始發表的相關文獻,輸入建檔,以供國內外人士參閱。
1.標本清查
標本清查為數位化最基本之步驟。
(1) 清點館號/流水號
由助理清點館號,並登記之。
(2) 紀錄標本標籤資料(對照植物索引碼)
需由熟悉植物分類學、命名法規等人員,依照植物分類學、命名法規、台灣植物誌等書籍進行資料記錄。
對照資料庫中之相關標準進行資料登記。
2. 標本修復
為保護標本之完整性,首先需使用刷子、孽子、無酸台紙、封套、膠帶、膠水等將標本上台紙,而後進行縫製或黏貼的動作,必要時可使用針、線。
本項動作之困難在於具修復經驗之人員難覓,且量多費時,需較多人員同時進行。
由具修復經驗人員仔細固定標本
3. 標本掃描
由於模式標本極其珍貴,在需兼顧維護標本完整性及高品質畫面兩相考量之下,選擇外包進行。
(1) 裝箱、運送
將整理完畢之標本裝箱運送。
由助理人員負責裝箱,準備運送。
(2) 掃描(外包)
請廠商使用平床式掃描機掃描。
並將圖檔儲存為三種格式:
典藏級:tiff 600dpi
電子商務級:bmp 300dpi
公共資訊級:jog 100dpi
4. 影像輸出
掃描完成之標本影像,則以下列3種方式儲存。
(1) 光碟(外包)
使用柯達金片。
(2) 紙本(外包)
(3) 轉存資料庫
資料庫畫面。(紅色箭頭為填入之欄位項目)
早年的標本較易損害,需優先建成影像檔。另外台灣原產4220種維管束植物具代表性的標本亦需加以製作成影像檔,以供各界人士鑑別植物時參閱之用。
1. 標本清查
(1) 清點館號及數量
由助理逐一清點館號及數量。
(2) 紀錄標本標籤資料
為防止破壞標本,紀錄標本資料時,宜戴無酸口罩及手套。
2. 標本修復
標本修復可使用無酸貼紙黏貼固定,或者針、線繡縫固定。
使用針、線、無酸貼紙,進行標本細部之固定。
3. 標本翻拍
(1) 核對清單
首先仍需再將等待翻拍之標本核對清單。
由助理清查標本清單。
(2) 翻拍
以科為單位,使用NICON COOL PIX5700數位相機,設定解析度150dpi,tiff檔。
將NICON COOLPIX5700固定於翻拍架,進行翻拍工作。
(3) 轉檔並存入資料庫
將翻拍完成的影像,使用PHOTOSHOP 7.0轉存JPG格式,並存放於資料庫當中。其中並依據翻拍影像,裁切標籤部分影像,進行標籤資料輸入。
使用PHOTOSHOP進行翻拍影像的轉檔及儲存。
4. 挑選標本
經過翻拍之後,針對翻拍的影像檔中葉、花、果較為完整並具代表性的標本,重新將標本取出,以便進行可使畫質更為清晰的掃描動作。
此挑選工作需具備長期研究及觀察標本之經驗,費時費力,人員難覓,事為本項工作困難之處。
由植物學碩士班以上,熟悉植物分類學、植物型態學等人員進行挑選。
5. 標本掃描
將挑選出的標本逐份掃描,並儲存為三種格式
典藏級:tiff 300dpi
電子商務級:bmp 200dpi
公共資訊級:jpg 100dpi
使用掃描器Umax MirageII「SCSI Scanner」
6. 影像輸出
掃描完成影像分別儲存為以下三種型式:
(1) 光碟:以32倍速CD燒錄機,燒錄於柯達金片。
(2) 紙本:使用印表機Epson Stylus Photo1290,並列印於彩色噴墨專用紙中儲存。
(3) 資料庫
儲存掃描之後影像於資料庫
台灣植物誌Flora of Taiwan共分6卷,目前已出版至第五卷,預計2002年完成所有內容並出版。
內容包括233科、1355屬及4220種之學名、型態描述、檢索、插圖、照片、引證標本、分布地區、總名錄、索引等。將此6卷臺灣植物誌進行文字暨影像資料之數位化,配合標本資料系統、物種影像及地理分布圖,將使得資料之運用更趨完備及有效。
1. 校正內容
台灣植物誌今年已完成第五冊。校正工作需由具備植物分類學、植物地理學之研究背景。
2. 文字輸入
由助理將內容輸入電腦檔案中。
3. 插圖掃描
將插圖利用掃描器Umax MirageII「SCSI Scanner」掃入電腦中,並使用Photoshop儲存為
電子商務級:bmp 200dpi
公共資訊級:jpg 100dpi
利用Photoshop將圖檔掃入。
4. 編輯內容
結合插圖與文字部分,重新編輯。
使用軟體Acrobat Editor進行編輯。
5. 整合資料庫
需請具有撰寫程式技術能力者,使用Visual Basic製作資料庫,進行資料庫整合。
6. 網站資料庫
需請具有編寫網頁與資料庫搜尋技術能力者,使用Visual Basic製作網站資料庫,方便一般使用者上網搜尋。
標本資料包括每一份標本的學名、採集地點、採集日期、採集者、鑑定者、採集編號、生育地資料、標本館編號、標本狀態等。
至於標本資料之輸入格式規劃及檔案結構,則需預先完成。
1. 輸入介面之設計
需請具有程式規劃與設計之技術,及植物學名分類系統背景者,製作使用TAI國內臘葉標本影像暨標籤資料輸入之介面。
TAI國內臘葉標本影像暨標籤資料輸入
2. 匯入標本及標籤影像
將標本及標籤影像匯入資料庫。
紅色箭頭部分為輸入欄位
3. 資料輸入
依據植物組後設資料需求規格書,及TAI標本館實際需求規劃資料,使用“TAI國內臘葉標本影像寄標籤資料輸入程式”將資料輸入,目前將資料存放於「塔山資料庫(台灣高等植物資料庫)」。
(1) 館號/份數/種類
紅色箭頭部分為輸入欄位
(2) 採集者
(3) 鑑定者
紅色箭頭部分為輸入欄位
(4) 植物名稱
紅色箭頭部分為輸入欄位﹔粉紅色框內為輸入欄位及標籤資料之翻拍影像對照。
(5) 採集地點
紅色箭頭部分為輸入欄位﹔粉紅色框內為輸入欄位及標籤資料之翻拍影像對照。
(6) 環境描述
紅色箭頭部分為輸入欄位﹔粉紅色框內為輸入欄位及標籤資料之翻拍影像對照。
(7) 訂正資訊
紅色箭頭部分為輸入欄位
4. 資料分析
依據植物組後設資料需求規格書,及TAI標本館實際需求規劃資料,使用“TAI國內臘葉標本影像寄標籤資料輸入程式”將資料輸入,目前將資料存放於「塔山資料庫(台灣高等植物資料庫)」。
(1) 輸入資料欄位調整
輸入畫面
(2) 標籤資訊校驗
紅色箭頭部分為輸入欄位
(3) 地名校正
由於標本館內許多標本的年代久遠,地名幾經更改,故需先校正地名。
紅色箭頭部分為輸入欄位
(4) 鑑定資料訂正
紅色箭頭部分為輸入欄位
(5) 資料庫更新
資料庫畫面
因本館標本的採集年代跨越清末、日據時代迄今,標本上出現之地名古今兼具,因此需一一核對過去的地圖、製作對照表,並加以建檔,以供標本研究時參考之用。
1. 收集相關文獻
包括台灣植物誌第一版及第二版、採集紀錄、標本處理工作日誌、地名吸觀之參考書籍等,以便進行古今採集地名之對照。
參閱相關書籍
2. 紀錄採集地名
採集地名對於標本有重要意義,除了紀錄之外,更可看出生態分布等重要的標本意義。
由助理進行採集地名之紀錄
3. 考證古今地名
由具有植物分類學、植物地理學等研究背景者,參閱地名相關書籍,進行地圖位置之核對。預計今年可完成450筆資料。
由助理按照地名相關書籍,逐項校對。
4. 核對地圖位置
由具有植物分類學、植物地理學等研究背景者,使用具座標系統資料之台灣地圖圖檔,進行地圖位置之核對。
由助理進行資料核對。
5. 數化採集地點
運用地理資訊系統軟體,將紀錄並核對完成之採集地點數位化。
6. 校正地名資料
(1) 資料庫更新
應用TAI國內臘葉標本影像暨標籤資料輸入程式,並參閱塔山資料庫(台灣高等植物資料庫)、植物組後設資料需求規格書、標本處理工作日誌、地名相關之參考書籍,以更新資料。
資料庫更新。
(2) 輸入標籤資料校正
參閱植物組後設資料需求規格書、標本處理工作日誌、地名相關之參考書籍,務求資料之正確無誤。
資料庫畫面
※製作單位:數位典藏國家型科技計畫 內容發展分項計畫 台灣大學植物學系標本館典藏數位化計畫
※文字撰寫:台灣大學植物學系標本館典藏數位化計畫
數位典藏國家型科技計畫 內容發展分項計畫 助理 許雅婷
※圖文編輯:數位典藏國家型科技計畫 內容發展分項計畫
植物主題小組助理 許雅婷
※圖片拍攝:數位典藏國家型科技計畫 內容發展分項計畫
植物主題小組助理 許雅婷
部分圖片提供:台灣大學植物學系標本館典藏數位化計畫
感謝:參與【台灣大學植物學系標本館典藏數位化計畫】之相關工作人員撥冗協助。特別感謝計畫主持人 謝長富老師指導。
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