國立台灣大學 昆蟲標本館數位典藏計畫 數位化工作流程簡介
Tags: 徵稿, 數位典藏, 數位化工作流程, 數位學習, 昆蟲, 會議, 檔案, 資料庫 發表: 2008-08-08, 點閱: 6,261 , 加入收藏櫃 , 列印 , 轉寄
台灣大學從民國八十六年即進行「國立台灣大學數位圖書館暨博物館計畫」,結合人類系、圖資系、歷史系、資工系、圖書館等單位的人力,開始將典藏的珍貴文獻、器物數位化,並自八十七年起同參與國科會數位博物館計畫。台灣大學的珍貴典藏涵蓋歷史文獻、考古、地質、動物、植物、昆蟲等,其中多與台灣本土有關。
台灣大學昆蟲標本館成立於日據時代,收藏無數珍貴標本;在台灣地區與農業試驗所並稱藏量最豐之兩大昆蟲標本館。蒐藏昆蟲標本的主要目的在於藉由昆蟲標本和相關資料的取得、保存與維護,作為自然歷史的佐證,經由標本的研究以了解自然史,並將蒐藏之標本及研究所得之成果提供人類學習與了解的途徑;因此標本的主要功能在於提供展示、科學教育及科學研究。而近年在全球提倡生物多樣性公約以來,昆蟲這一類物種多樣性最高的類群更是受到高度的重視;為了永續利用昆蟲資源,必須以最有效率的方式加以管理。標本為無價之寶,應當受到相當高度的重視及妥善的管理與維護。
本年度工作項目為:
1. 清查昆蟲標本館收藏之標本,作分類與整理。
2. 模式標本影像數位化。
3. 蟲籤等舊有資料建檔及數位化。
4. 常見昆蟲(研究及教學標本)影像數位化。
5. 標本metadata文字資料庫建檔與校對。
6. 昆蟲管理系統網頁架設。
7. 對外查詢檢索網頁測試。
數位化工作流程:
台灣大學昆蟲標本館典藏數位化計畫之數位化工作流程圖文說明,共分成三部分同時進行數位化工作,即常見昆蟲解說文字資料庫、常見昆蟲標本照、模式標本照,其各部分之細部數位化步驟,如下:
圖一、完整數位化工作流程圖
l 常見昆蟲解說文字資料庫
圖二、常見昆蟲解說文字資料庫流程圖
由熟悉昆蟲分類與整理方法的工讀生2名,利用標本箱、標本盒、鑷子…等其他工具,大約每盒花費1個半小時,常見昆蟲標本選取自己完成鑑定至科之研究與教學標本,數量極大,且歷史悠久,正逐步清查整理中。
圖三、標本整理 |
圖四、選取完整且具代表性之昆蟲標本 |
由具有昆蟲分類專長的2名工讀生,利用標本箱、標本盒、鑷子…等其他工具,大約花費每隻30分的時間,參考普通昆蟲學…等書籍,核對標本、查閱書籍該標本之相關資訊。
圖五、查閱相關書籍
由修習過昆蟲分類學與實習的2名工讀生,利用PC之MS2000之Word & Access套裝軟體,進行分析整理文字資料,每筆資料大約需耗時50分鍾,並且在此進行同時,再必要時亦有碩士級助理從旁協助該名工讀生於分析整理文字資料。
圖六、分析整理文字資料
由2名工讀生進行將所整理分析之文字資料,依照中央研究院動物主題小組統一之共通欄位,將資訊輸入欄位並儲存,以完成每筆metadata,每筆約需30分鐘來完成。
圖七、key in metadata(暫用Access)
圖八、常見昆蟲文字資料庫
由2名工讀生進行查閱專業書籍並核對標本,利用PC與LEICA顯微鏡…等工具施行,每隻標本約需耗時30分鐘。
圖九、特徵辨識-1
圖十、特徵辨識-2
由2名工讀生整理標本相關資料,利用PC並參考昆蟲分類學以進行特徵影像圖說,每隻標本大約需耗時20分鐘。
圖十一、輸入特徵影像圖說
由1名需具有昆蟲分類背景之工讀生,利用PC並參考昆蟲分類學以進行校對的工作,每筆資料大約需耗時20分鐘。
圖十二、校對
l 常見昆蟲標本照
圖十三、常見昆蟲標本照流程圖
(內容)
一、 標本分類與整理
常見昆蟲標本選自已完成鑑定至科之研究與教學標本,數量極大,且歷史悠久,正逐步清查整理中。由2名熟悉標本處理的工作人員,利用標本箱、標本盒、蟲籤、鑷子…等相關工具,將常見昆蟲標本分類並整理,每盒平均處理約為一個半小時。
圖十四、標本分類與整理
二、 挑選合適標本
由兩名具有昆蟲分類背景的工作人員,使用鑷子、放大鏡或LEICA顯微鏡以及電腦,來挑選合適的昆蟲標本,平均每隻昆蟲處理時間約為15分鐘。
圖十五、挑選合適標本
三、 拍照標本照
由2名具有昆蟲分類背景並熟悉使用攝影工具的工作人員,利用LEICA顯微鏡、Chroma數位攝影機、NIKON D1數位相機、VISIO翻拍燈與翻拍架,將選出的昆蟲標本進行數位攝影步驟,每隻昆蟲翻拍約需耗時約40分鐘。
圖十六、大型標本使用Nikon D1數位相機及翻拍架、翻拍燈
圖十七、拍攝1
圖十八、拍攝2
圖十九、拍攝3
圖二十、蝴蝶標本
四、 標本照去背及後續影像處理
由2名熟悉影像處理軟體的工作人員,將之前已數位攝影完成之數位影像檔進行後續處理工作,如去背、修色…等工作,每筆影像檔約需耗時1小時。未來則考慮委外製作。
圖二十一、去背處理
五、 標本照加浮水印處理
此步驟由中央研究院資訊所支援,並尚未進行浮水印處理。
六、 標本照命名與建檔
由2名熟悉文書處理的工作人員,將修訂好的常見昆蟲標本照(數位影像檔),存成三種不同大小與解析度的圖檔,每筆轉存不成格式影像檔,約需耗時15分鐘,該三種影像檔包括典藏檔、電子商務檔、公共資訊檔,均依據技術彙編的影像檔規格。
七、 查詢分類資料
由2名具昆蟲分類背景的工作人員,開始查詢各昆蟲標本照之分類資料,並參考普通昆蟲學…等參考書目,每筆資料約耗時30分鐘處理完成。
圖二十二、查閱相關書籍
八、 拍攝科級特徵影像
由2名會操作攝影工具之工作人員,利用電腦、LEICA顯微鏡、Chroma數位攝影機…等工具,近處拍攝昆蟲細部特徵,每隻昆蟲約耗時1小時拍攝科級特徵。
圖二十三、選取玻片標本
圖二十四、選取玻片標本
圖二十五、玻片標本
圖二十六、使用光學顯微鏡擷取影像
圖二十七、科級特徵辨識
圖二十八、使用數位攝影機拍攝
九、 後續影像處理
由2名熟悉影像處理軟體的工作人員,利用影像處理軟體,將上步驟所拍攝之特級特徵,進行影像處理與修正,每筆資料約需耗時1小時。
圖二十九、影像處理
圖三十、套上底色並加註物種名稱
十、 特徵影像加浮水印處理
此步驟由中央研究院資訊所支援製作,並尚未進行特徵影像加浮水印處理。
十一、特徵影像命名與建檔
由2名熟悉文書處理的工作人員,將經過影像處理完成之常見昆蟲標本照圖檔以及特級特徵圖檔,進行命名,並在資料庫輸入介面建立圖檔,每筆資料約耗時15分鐘。
圖三十一、特徵影像建檔與命名
十二、再次校對後上傳至網頁
由2名具有昆蟲分類背景之工作人員,再次將資料庫中之資料進行二次校對,待正確無誤之後始傳至網頁上,供使用者利用。每筆皆約需10分鐘處理。
十三、資料備分
由1名工作人員,將正確無誤之所有資料,利用燒錄軟體NERO 5.5,燒錄成DVD光碟。每筆燒錄約需耗時20分鐘。
圖三十二、資料備份
圖三十三、燒錄光碟片
l 模式標本照
圖三十四、模式標本照流程圖
一、 標本維護修復
由1名熟悉昆蟲標本整理工作的工作人員,利用顯微鏡、鑷子…等製作標本工具,並參考普通昆蟲學,執行標本維護修復,本之標本製作時間不定,全視標本狀況而定。
本館所典藏之模式標本多為日據時代迄今,因年代久遠且保存設備老舊,致標本多有虧損,故整理上有一定之困難度。
圖三十五、標本維護修復
二、 分類整理
由1名具有昆蟲學分類學背景的工作人員,利用昆蟲標本箱製作標本相關用品,並參考普通昆蟲學參考書目,來整理並分類這些模式標本,其每隻模式標本處理時間,並無一定,全依照該標本狀況而定。
圖三十六、分類整理
三、 拍攝模式標本照
由2名熟悉使用攝影器材的工作人員,利用顯微鏡、數位攝影機、環行燈、電動手臂、數位相機…等工具,執行模式標本的拍照,模式標本的執行速度,全視標本狀況而定。
圖三十七、對焦與位置調整
圖三十八、拍照—顯微攝影
圖三十九、Leica顯微鏡及數位攝影機
圖四十、電動手臂
四、 多張模式標本照影像合成
由1名熟悉影像合成軟體的工作人員,使用auto-montage、MS-2000…等軟體工具,進形模式標本的影像合成作業,平均每張影像約處理10分鐘。
圖四十一、影像合成步驟-a.選取連續影像檔
圖四十二、影像合成步驟-b.檔案開啟中
圖四十三、影像合成步驟-c.開啟完成
圖四十四、影像合成步驟-d.將各影像檔校正
圖四十五、影像合成步驟-e.校正完成
圖四十六、影像合成步驟-f.選擇合成方式
圖四十七、影像合成步驟-g.影像合成中
圖四十八、影像合成步驟-h.影像合成完成
五、 模式標本照去背及後續處理
由2名熟悉影像處理軟體的工作人員,利用MS-2000、Photoshop 6.01、KNOCK-OUT…等軟體工具,進行去背與後續處理,平均每一張約進行1小時。
圖四十九、影像檔案去背處理-a.開啟合成影像檔
圖50:影像檔案去背處理-b.去除蟲針及背景雜色
圖五十一、影像檔案去背處理-c.去背完成
圖五十二、影像檔案去背處理-d.加上比例尺及物種學名
圖五十三、影像檔案去背處理-影像檔案後續處理(例二)
圖五十四、影像檔案去背處理(例二)-a.去除背景雜色
圖五十五、影像檔案去背處理(例二)-b.旋轉影像30°(順時針)
圖五十六、影像檔案去背處理(例二)-c.加上合適底色及細部修復
六、 模式標本照建檔與命名
由2名熟悉影像處理軟體,利用MS-Access、Photoshop 6.01…等軟體工具,將檔案與命名方式依照規格,轉存三種影像檔格式,平均處理15分鐘。
圖五十七、建檔與命名
圖五十八、蟲籤
圖五十九、蟲籤拍攝
圖六十、輸入後設資料-模式標本資料庫-紀錄蟲籤資料
七、 模式標本照加上浮水印處理
本步驟預計由中央研究院資訊所支援,並尚未進行模式標本照加浮水印處理。
八、 資料備份
由1名會操作燒錄軟體的工作人員,運用燒錄機Nero 5.5…等軟體工具,燒錄成DVD,平均每片DVD約耗時15分鐘。
圖六十一、資料備份
圖六十二、燒錄DVD
九、 上傳網頁
由1名熟悉電腦操作的工作人員,將資料上傳至網頁,此部分是由中央研究院資訊所支援,平均所費時間皆視檔案大小時定。
※以上數位化工作流程簡介之文字,主要是參考「台大昆蟲標本館常見昆蟲解說文字資料庫數位化工作流程調查表」、「台大昆蟲標本館常見昆蟲標本照數位化工作流程調查表」、「台大昆蟲標本館模式標本照數位化工作流程調查表」、【國家數位典藏國家型計畫中程綱要計畫書】。
※製作單位:數位典藏國家型科技計畫-內容發展分項計畫
台灣大學昆蟲標本館典藏數位化計畫
※文字撰寫:台灣大學昆蟲標本館典藏數位化計畫計畫助理 童鈺珽小姐
※圖文編輯:數位典藏國家型科技計畫-內容發展分項計畫
動物主題小組助理 汪怡慧、曾欣怡
※圖片拍攝:台灣大學昆蟲標本館典藏數位化計畫計畫助理童鈺珽小姐
動物主題小組助理 陳冠伊
※感謝:台灣大學「台灣大學昆蟲標本館典藏數位化計畫」之計畫主持人蕭教授旭峰撥冗指導及提供實地拍攝與簡介編寫。並感謝童鈺珽小姐等相關計畫人員的協助
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