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國立嘉義大學 嘉大昆蟲館昆蟲標本立體數位典藏計畫數位化工作流程

Tags: , , , , , , , , , , , , 發表: 2010-09-15, 點閱: 5,877 , 加入收藏櫃 , 列印 列印 , 轉寄 轉寄

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執行單位國立嘉義大學資訊工程學系

 

計畫主持人國立嘉義大學資訊工程學系 陳耀輝 副教授

 

共同主持人:國立嘉義大學生物資源學系暨研究所 郭章信 副教授

 

計畫名稱:嘉大昆蟲館昆蟲標本立體數位典藏計畫

 

計畫簡介

 

本計畫之目的在於為嘉義大學昆蟲館建立昆蟲標本立體數位化典藏,預計將建立整合資料庫存放館內400件昆蟲標本之相關資料及數位影像,針對部份具代表特色之昆蟲標本建立3D立體模組,建置網站以提供資料之展示與檢索功能,以提供公眾利用與資訊流通,提高典藏標本的附加價值。

 

計畫網站:http://insect.ncyu.edu.tw/dap/

 

 

 

  目      錄 

計畫簡介


工作流程圖

 

一、昆蟲標本拍攝

 

二、立體昆蟲拍攝

 

三、計畫網站建置

 

四、計畫運作與系統維護

 

 

嘉大標本館溫室全景圖

數位化工作流程圖

嘉大昆蟲館昆蟲標本立體數位典藏計畫提供

 


 

<目 錄>

 

 

一、 昆蟲標本拍攝

 

 

(一)標本分類、整理

 

為能與TaiBNET所使用的昆蟲綱25目分類系統能接軌,因此將昆蟲館原先使用的32目昆蟲綱分類,做些微的調整,藉此也將館中的昆蟲標本做清點與整理,所有標本在清點的過程中,皆進行如除霉等基本整理,所需的時間,視標本種類與狀況而定,如鞘翅目昆蟲以酒精除霉約需5分鐘。

 

 

(二)標本挑選

 

該館所挑選典藏的物種,以一般臺灣常見、體型較大、較具觀賞價值,以及國中小學學生較有興趣的昆蟲種類為主,例如鞘翅目鍬形蟲科(如鍬形蟲)與兜蟲亞科(如獨角仙)之標本。藉此提升網站普及化與使用率。而標本的選擇則挑選無損壞、型態完整,以及同物種不同性別、不同型態的物種,提高同一物種的完整度,防止因物種個體差異,造成民眾混淆[1],有利於未來教育研究使用。物種的確認主要參考昆蟲學、Fundamentals of Entomolgy等書中的昆蟲分科索引表,核對標本分類等資料的正確性,必要時邀請各類昆蟲學專家來協助辨識。挑選完欲拍攝的標本,會另外放置於另一個標本箱中,方便日後進行典藏與數位化。

 

 

(二)填寫標本資料

 

在進入正式拍攝前,用電子游標卡尺測量蟲體的寬度,同時記錄採集簽上的內容。以紙本方式,填入標本館藏資料表。

 

 

 

(二)標本影像拍攝

 

標本的數位化作業是將設備架設於標本館的工作室中,設備包括翻拍架、冷光燈、Canon 5D相機、快門線,拍攝蟲體主要使用Canon EF100mm f/2.8 USM微距鏡頭,若有要拍攝細部特徵,則改使用Canon MP-E65mm f/2.8 1-5X 微距鏡頭。欲拍攝的蟲體插在白色珍珠板上,調整光圈快門後拍攝。依照蟲體的特色,會翻轉幾個角度進行腹部、側面的拍攝。此外,例如像是珠光鳳蝶金黃色的後翅,在逆光時透過光線的折射會呈現出閃亮的珍珠光澤[2],所以拍攝時也會擺特殊的角度,讓蟲體的特稱顯現出來。因為典藏之標本採集年代較近,文字辨識也清楚,所以並無另外拍攝採集籤。

 

一般情況都會採用光圈先決,多點對焦的方式拍攝,每一隻蟲的同一部位或角度都會拍攝5-10張,再於後製時挑選適合的影像。若是昆蟲體軀較厚(如獨角仙),或是姿勢較為立體,對焦上會比較困難,就會採用手動方式調整光圈、快門與對焦,並且拍攝多張對焦於不同點上的照片,再於後製中挑選。會同時拍攝RAW與JPEG影像,解析度為5,616 × 3,744 dpi。

 

 

 

(三)標本數位化影像檢視與後製

 

標本拍攝完畢後,透過記憶卡,將資料傳入後製的電腦,以Adobe Photoshop做色彩、清晰度、加浮水印、去背等處理,在色彩校正時,還需將原件置於身旁,以確認顏色是否與原件相同。

 

 

 

影像裁切、去背與加浮水印的詳細流程如下[3]

 

1. 開啟所拍攝照片

 

 

2. 裁剪所拍攝照片

 

 

3. 新增1,350 x 900像素尺寸圖檔,將裁剪好之圖片貼上,並將圖片拉滿整個版面,並將標本調正處理。

 

 

4. 調整圖片色階、亮度、對比、飽和度等,使其更符合實際標本色澤。

 

 

5. 去背處理,也將陰影的部分去除。

 

 

6. 加浮水印:位置視蟲種而定,如鱗翅目於左前翅端部,鞘翅目昆蟲於翅鞘末端。

 

 

7. 將原始影像縮小為180 × 120 dpi、600 × 400 dpi、1,350 × 900 dpi等三種尺寸的JPEG檔。

 

 

 


 

<目 錄>

 

 

二、立體昆蟲拍攝

 

該館立體昆蟲拍攝是採委外進行,將昆蟲標本小心擺置在可調度數的轉盤,拍攝360度昆蟲標本環物照,依昆蟲體型大小而有所差異,平均一隻約2小時的拍攝時間。拍攝完成先利用Photoshop進行影像的合成與去背,在利用環物軟體合成,製成Flash格式的檔案,以利網路上的播放。

 

 


 

<目 錄>

 

 

三、計畫網站建置

 

(一) 需求分析

 

計畫於執行前期,約有三個月的時間(98.9-98.11),每週由開發團隊向昆蟲館進行一次訪談,並記錄訪談內容,以便進行初步需求分析。在訪談後,網站開發團隊也會召開一次網站開發會議,根據需求討論網站設計的各項細節,並作為下一次訪談所需的提問。在初步需求分析後,開發團隊則直接與標本館聯絡人聯繫,隨時視需求變更或調整設計。在需求分析階段,需瞭解不同類型使用者的需求,包括訪客、會員、管理者,以及數位典藏與數位學習國家型科技計畫盤點人員與聯合目錄資料匯入人員的需求。讓計畫可以以最簡單、快速的方式,將各使用者需要呈現或匯出資料。

 

 

(二) 軟硬體架設

 

軟體的配置主要考量軟體的相容性、穩定性,以及資源取得的難易度;硬體的部分則考量資料儲存空間需求與資料備份的難易度。計畫架設主機與測試機,環境需維持一致,以方便系統的測試與網站的營運。採用的作業系統是Windows Server 2003 SP2,網頁伺服器是採Apache Web Server 2.28,資料庫設計是My SQL 5.0.51b,網站介面是以Dreamweaver軟體做設計,以Notepad++ [4]筆記本軟體來編寫PHP網頁程式語言。

 

(三) 資料庫與網站介面設計

 

資料庫規格設計同時考量現有典藏品資料、權利盤點工作、聯合目錄資料匯入格式,與未來可能的功能擴充,例如權利盤點是以程式自動會出至盤點表(Excel格式);聯合目錄的部分則以程式自動匯出,以照片為單位的二維表格(Excel格式),網頁語言均需符合W3C標準。除此之外,也參考了許多數位典藏計畫下同類型的網站設計,包括台灣大學昆蟲標本館數位典藏、農業試驗所昆蟲標本館數位典藏、林業試驗所昆蟲標本典藏與國立自然科學博物館數位典藏等網站。網站有問與答、Q&A之設計,提供民眾提出疑問的空間,還有常見問題的列表與搜尋功能,可提高網站的實用度,而問題之回覆將會由館方人員執行,與昆蟲相關的新聞或文章,也會透過電子報寄發給會員。

 

 

(四) 後設資料建置與上傳

 

計畫建後設欄位(Metadata)時,主要依據DarwinCore之欄位做設計,也參考一般大眾查詢頻率較高之昆蟲資訊,以及昆蟲館遊客想要了解昆蟲資料,所以除了DarwinCore欄位外,還增加了物種的生態資料、型態特徵、食物與棲地之欄位,在前端呈現實,若有加入會員的使用者,除了昆蟲基本資料與圖片外,有的種類還提供飼養手冊,讓民眾對於昆蟲有更進一步的認識。資料輸入時也參考昆蟲相關書籍,以便進行資料的輸入與校驗,在昆蟲採集地點的資料輸入,則是利用Goolge map或Google Earth,輸入經緯度,來確認昆蟲採集地是在台灣的那個縣市。

 

 

 

(五) 網站測試與備份機制

 

資料庫與網站程式在開發的機器實作完成後,會先在測試機上以多種瀏覽器測試過,運作無誤後,才能移至正式機上運作。網站與後設資料的備份是使用兩個硬碟槽,一是作為存放網站與資料庫使欲,另一則是作為資料的備份。在資料登錄期間,網站系統每週會進行一次備份,在資料登錄完畢後,每月會再進行一次的備份。

 

 


 

<目 錄>

 

 

四、計畫運作與系統維護

 

未來資料庫內容的擴增、整理與使用者問題回覆,會由嘉義大學昆蟲館工作人員執行工作。除了數位典藏計畫外,由系所共同負擔嘉大昆蟲館相關教學課程,以及嘉義地區昆蟲推廣教育。未來也希望能針對花卉與蔬菜害蟲進行數位化的工作,並加地區昆蟲作為嘉大昆蟲館的典藏特色,增加主題性與特色性的典藏。

 

製作單位:國立嘉義大學:嘉大昆蟲館昆蟲標本立體數位典藏計畫

 

數位典藏與數位學習國家型科技計畫 拓展台灣數位典藏計畫

 

圖文編輯:國立嘉義大學:嘉大昆蟲館昆蟲標本立體數位典藏計畫

 

數位典藏與數位學習國家型科技計畫 拓展台灣數位典藏計畫           計畫助理 陳秀華

 

圖片拍攝:數位典藏與數位學習國家型科技計畫 拓展台灣數位典藏計畫        計畫助理 陳秀華、褚如君

 

圖文提供:國立嘉義大學:嘉大昆蟲館昆蟲標本立體數位典藏計畫

 

致謝:

 

感謝國立嘉義大學「嘉大昆蟲館昆蟲標本立體數位典藏計畫」計畫主持人與共同主持人陳耀輝教授、郭章信教授撥冗指導及提供實地拍攝、相關資料與圖文編輯,並感謝計畫工作同仁林幸鈺、蘇郁喬、李信賢、陳宇達、蔡佾翰、王竣弘、潘佳娜的協助。



[1] 同一物種通常會挑選1-2隻,盡可能將雄性與雌性的蟲體都進行典藏,若有多型態的種類,例如冬型、夏型的蟲體,或是有明顯差異的特徵,則進行多隻典藏。

 

[2] 資料來源:蘭嶼資訊服務網。http://lanyu.taitung.gov.tw/e_travel/e_travel-1.htm

 

[3] 後製流程說明由嘉大昆蟲館昆蟲標本立體數位典藏計畫提供。

 

[4] Notepad++是一款免費的Open Source的軟體,他除了有如windows記事本的功能,也提供了數十種常見的程式語言的語法支援。資料來源:http://toget.pchome.com.tw/intro/business_wordprocessing/23486.html

 

 


 

<目 錄>

 

 

 









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