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中央研究院 台灣動物相典藏之研究:魚類與貝類- 台灣魚類相之數位典藏

Tags: , , , , , , , 發表: 2008-08-08, 點閱: 3,848 , 加入收藏櫃 , 列印 列印 , 轉寄 轉寄

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單位:中研院動物所

 

計畫主持人:中研院動物所研究員 邵廣昭先生

 

計畫簡介

 

台灣因地理位置優越,生物多樣性十分豐富,海洋生物的物種即佔了全球約1/10以上的比例。其中魚類種數高達2500種,分布在河川、海域珊瑚礁、河口等各種不同的生態系中,特別是許多珍稀或本土特有的魚種,更是值得關心及保育。本計畫擬以已建構的“台灣魚類資料庫”為基礎架構,加速修訂及更新該資料庫的內容,使其在短期內可將台灣近2500種魚類的正確資料予以數位典藏。此等具權威及正確性的學術研究成果資料完整建立後,將利用多媒體資料庫技術整合、管理、維護,並提供國內外各界透過網路公開瀏覽、查詢、擷取及使用。

 

 

  目      錄 

計畫簡介

 

一、基本資料-生態照

 

二、基本資料-生態影片

 

三、基本資料解說

 

四、文獻資料

 

五、標本資料-標本資料

 

六、標本資料-標本照

 

 

計畫目標:91年度主要目標為魚類標本之數位化

 

工作流程說明

 

一、基本資料-生態照

 

1.潛水拍照

 

(1)單眼相機

 

相機規格;Nicon F90X

相機規格:Nikonos V 100m

 

(2)數位相機

相機規格:SONYDSC-P5

 

2.拍攝結果處理

 

(1)正片沖洗

 

單眼相機以底片儲存影像,須先將照片沖洗為幻燈片。

                     紅鱠魚之幻燈片檔案

 

(2)檔案輸出至個人電腦

 

數位相機所拍攝的檔案,都存在於數位相機中的記憶卡,等同於單眼相機之底片。記憶卡內的資料,須經由讀卡機將檔案從記憶卡中輸出至個人電腦。

 

讀卡機

 

3.檢視拍攝結果

 

將幻燈片放置於幻燈片檢視檯,以幻燈片放大器檢視拍攝結果之焦距是否清楚,光線是否充足。

 

利用幻燈片檢視檯,以幻燈片放大器檢視拍攝結果

 

4.鑑定魚種

 

鑑定拍攝回來的結果,可參考台灣魚類誌、日本產魚類檢索、其他魚類分類相關書籍等書籍。

 

參考魚類相關書籍,以便於鑑定拍攝回來的魚種

 

5.幻燈片掃描

 

將檢查完成,及鑑定好的幻燈片資料,利用掃描器轉為數位化檔案保存。

 

掃描幻燈片之工作情形

幻燈片掃描機規格:Nokpn coolscan IV 4000 ED(可批次掃描,機器借於中研院多媒體中心)

 

6.數位影像修改

 

輸入個人電腦之後的標本照,皆需要於電腦中將圖檔重新修飾。不論是解析度、

 

尺寸規格、畫面的美觀,都需要熟悉電腦繪圖軟體(如:Photoshop)人員加以修改。

 

 

7.存放檔案

 

整理完成的圖檔即可儲存於電腦或光碟片中,成為數位化的檔案。

 

不過為了因應使用的途徑不同,須先將標本照依照「典藏級圖檔、網頁用圖檔、

 

網頁縮圖預覽圖檔」三種需求,轉為三種不同的格式儲存。

 

典藏級圖檔:單眼相機-1200 dpi. 32 bit, TIFF、

   

             數位相機-2048 X 1536 JPG

 

網頁用圖檔:300 x 138 72 dpi, JPG

 

網頁縮圖預覽圖檔:100 x 48, 72 dpi, JPG

 

電腦畫面

 

8.建立Metadata 欄位資料

 

電腦畫面

 

9.備分至檔案伺服器

 

為避免資料因各種可能發生之原因遺失,再將整理好的資料同時備份至伺服器。

 

檔案伺服器電腦畫面

  


 

<目 錄>

 

二、基本資料-生態影片

 

1. 潛水攝影(DV)

 

此項工作須具有潛水執照的魚類相關專業人員執行,並具備基本的水中攝影技巧,故甚富難度。

 

圖片下方為數位攝影機,規格為:SONY VX-1000

 

圖片上方為數位攝影機之防水殼,規格為:Amphibico VH-1000

 

2. 記錄拍攝時間

 

檢視拍攝回來的影帶,並將需要的段落時間記錄下來,可便利於之後的轉出工作。

 

3. 資料轉出

 

將數位化影像經由擷取卡從影帶中轉出至個人電腦。

 

擷取生態影片之工作情形

機器規格:SONY TRV-900

 

4. 影片壓縮轉檔

 

由於拍攝結果須上傳至網路,檔案過大則不利於傳輸,以及網路使用者的下載,故須先將影片檔案壓縮、轉檔,成為方便使用的較小檔案。

 

本項工作平均需要花費2~3倍的拍攝時間,處理起來極為耗時。

 

電腦畫面

 

5. 影片編碼存檔

 

依流水號編目存檔

 

電腦畫面

 

6. 影片基本解說資料撰寫

 

需要.對魚類有一定程度研究之人員撰寫。

 

電腦畫面

 

7. 建立Metadata 欄位資料

 

依照魚類metadata 需求規格書之規格輸入。

 

電腦畫面

 

8. 輸入資料庫

 

平均約2~3分鐘,可輸入一筆資料。

 

電腦畫面

 

9. 備分至檔案伺服器

 

安排於每週末更新一次資料,以輸入檔案伺服器。

 

電腦畫面

 


 

<目 錄>

 

三、基本資料解說

 

1. 蒐集相關資料,參考魚類分類相關書籍

 

需要對生物相關科系或對魚類有一定程度認識的工作人員,可參考Fishes of the world, Nelson 1994、FishBase

(http://www.fishbase.org)、台灣魚類誌等相關工具等其他相關魚類分類書籍。

 

電腦畫面

 

2. 著手撰寫魚類形態特徵,基本解說資料需求同上。

 

電腦畫面

 

3. 建立Metadata 欄位資料

 

可依照魚類metadata 需求規格書依序填入蒐集完備之資料。

 

電腦畫面

 

4. 輸入資料庫

 

平均約2~3分鐘,可輸入一筆資料。

 

電腦畫面

 

5. 備分至檔案伺服器

 

安排於每週末更新一次資料,以輸入檔案伺服器。

 

電腦畫面

 


 

<目 錄>

 

四、文獻資料

 

1.蒐集相關文獻

 

可搜尋與魚類分類、分布、生態、演化、資料庫、保育等生物相關發表之文獻。

 

 

2.文獻資料登錄

 

已有文獻管理系統。

 

 

3.建立Metadata 欄位資料

 

可依照魚類metadata 需求規格書依序填入蒐集完備之資料。

 

電腦畫面

 

4.輸入資料庫

 

 

5.備分至檔案伺服器

 

每星期六備份。

 

 


 

<目 錄>

 

五、標本資料-標本資料

 

1.魚種鑑定

 

需要工具如下;解剖顯微鏡、ZEISS MC80DX、解剖剪、解剖刀、鑷子、不鏽剛平底盤、燈光、放大鏡等,並參照台灣魚類誌、日本產魚類檢索其他魚類分類相關書籍。

 

解剖顯微鏡ZEISS MC80DX

鑑定魚種時所須之工具

 

2.魚類標本製作

 

由具有製作標本經驗者,利用福馬林、酒精、標本保存瓶等工具,經由標本製作程序製作(附錄一)標本。

 

標本保存瓶

 

3.登錄標本館館藏編號 (ASIZP)

 

以流水號編目,將標本收藏於標本館。

 

 

4.標本基本資料登錄

 

 

5.標本發表文獻歸檔

 

電腦畫面

 

6.建立Metadata 欄位資料

 

可依照魚類metadata 需求規格書依序填入蒐集完備之資料。

 

電腦畫面

 

7.輸入資料庫

 

電腦畫面

 

8.備分至檔案伺服器

 

每星期六備份。

 

位於標本館內的伺服器

伺服器硬碟

 

電腦畫面

 


 

<目 錄>

 

 

六、標本資料-標本照

 

1.拍照

 

(1)單眼相機

 

將單眼相機固定於拍攝用的機台,並調整好光圈、焦距、快門。

將攝影室內的多餘燈光關上,即可開始拍攝工作。

 

(2)數位相機

 

將數位相機固定於拍攝機台,即可開始進行拍攝工作。

 

(以下步驟同生態照之數位化工作流程。)

 

2.拍攝結果處理

 

3.檢視拍攝結果

 

4.鑑定魚種

 

5.幻燈片掃描

 

6.數位影像修改

 

7.存放檔案

 

8.建立Metadata 欄位資料

 

8.建立Metadata 欄位資料

 

9.備分至檔案伺服器

 

※製作單位:數位典藏國家型科技計畫 內容發展分項計畫 中央研究院台灣動物相典藏之研究-台灣魚類相之典藏

 

※文字撰寫:中央研究院台灣動物相典藏之研究

 

-台灣魚類相之典藏助理 林耿賢

 

數位典藏國家型科技計畫 內容發展分項計畫 助理 許雅婷

 

※圖文編輯:數位典藏國家型科技計畫 內容發展分項計畫

 

動物學主題小組助理 許雅婷、

 

※圖片拍攝:數位典藏國家型科技計畫 內容發展分項計畫

 

動物學主題小組助理 許雅婷

 

部分圖片提供:中央研究院台灣動物相典藏之研究-台灣魚類相之典藏

 

感謝:參與【中央研究院台灣動物相典藏之研究-台灣魚類相之典藏】之相關工作人員撥冗協助。特別感謝計畫主持人 邵廣昭老師指

導。

 


 

<目 錄>









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